RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MIER3Q7Z3K6 550 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PDSS2Q86YH6 399 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TPH2Q8IWU9 490 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RASSF8Q8NHQ8 419 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GPT2Q8TD30 523 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 KCNG4Q8TDN1 519 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MORC4Q8TE76 937 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC15Q8TF66 581 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SCFD2Q8WU76 684 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 STAMQ92783 540 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SCAMP4Q969E2 229 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 VKORC1Q9BQB6 163 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SDF4Q9BRK5 362 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TEKT3Q9BXF9 490 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CDH19Q9H159 772 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MLXIPQ9HAP2 919 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 POLD4Q9HCU8 107 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RLIMQ9NVW2 624 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RGL1Q9NZL6 768 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LRWD1Q9UFC0 647 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 A0A0B4J269 797 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM150BA6NC51 233 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 F5H697 171 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LAD1O00515 517 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TBX3O15119 743 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MED24O75448 989 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 STAM2O75886 525 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 BMP15O95972 392 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PFKFB1P16118 471 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CMA1P23946 247 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CASP1P29466 404 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ICAM3P32942 547 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PRPHP41219 470 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 UBA7P41226 1012 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3CGP48736 1102 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ACTR2P61160 394 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 UBE2HP62256 183 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PSMC6P62333 389 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 DSC2Q02487 901 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ITIH3Q06033 890 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP1Q07960 439 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TUBB3Q13509 450 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CAMK4Q16566 473 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 HSDL1Q3SXM5 330 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RESP18Q5W5W9 173 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 NIPA1Q7RTP0 329 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf80Q86SX3 495 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 OR6J1Q8NGC5 347 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 AFG1LQ8WV93 481 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RGMAQ96B86 450 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 DHX58Q96C10 678 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 FAM20AQ96MK3 541 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA33Q96N06 139 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 RIT2Q99578 217 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CNPPD1Q9BV87 410 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MAF1Q9H063 256 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D22BQ9NU19 505 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF236Q9UL36 1845 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ELP1O95163 1332 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 E9PMD0 336 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 C1QL1O75973 258 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 SLITRK3O94933 977 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CHEK2O96017 543 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 PGK1P00558 417 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 GH1P01241 217 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 MYL3P08590 195 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF286BP0CG31 522 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CYBAP13498 195 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRC-211ENST00000484135 CHRM3P20309 590 aa5.19□□□□□ -1.58
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