RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482072.1

ABCA9-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 3

Gene ABCA9, Length 235 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-205	ENST00000482072	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF84	P51523	738 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	UFM1	P61960	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CYP4F2	P78329	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GAB1	Q13480	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TDG	Q13569	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TOMM20	Q15388	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	MEA1	Q16626	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KAT2B	Q92831	832 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072		A6NCN8	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	AP3D1	O14617	1153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	PER2	O15055	1255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TSPAN9	O75954	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RNF8	O76064	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF202	O95125	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SPARC	P09486	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TACR3	P29371	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	MTNR1A	P48039	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RARRES1	P49788	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	EFNB1	P98172	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	CUL4A	Q13619	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	HSPH1	Q92598	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KLHL29	Q96CT2	875 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TIMP4	Q99727	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	PRRX2	Q99811	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TNFSF14	O43557	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	TMCC2	O75069	709 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	UROD	P06132	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	NFKBIA	P25963	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	MLH1	P40692	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	BLK	P51451	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ABCA9-205	ENST00000482072	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms