RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 HMGB4Q8WW32 186 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 IP6K1Q92551 441 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 RMDN3Q96TC7 470 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 WIZO95785 1651 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 SMARCA4P51532 1647 aa3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 BICRAQ9NZM4 1560 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 GAGE12JA6NER3 117 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 EFCAB8A8MWE9 144 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 MSI1O43347 362 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ACTL6BO94805 426 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 NFATC1O95644 943 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 LDHAP00338 332 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 KLKB1P03952 638 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 LCKP06239 509 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 CYP21A2P08686 494 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ARRB2P32121 409 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 CIITAP33076 1130 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 STAT1P42224 750 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 PGGT1BP53609 377 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 HILS1P60008 231 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ZXDBP98169 803 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 PPATQ06203 517 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ASIC2Q16515 512 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 GALNTL6Q49A17 601 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF569Q5MCW4 686 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ASB5Q8WWX0 329 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 RNF146Q9NTX7 359 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 UNC13AQ9UPW8 1703 aa3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 AGAP5A6NIR3 686 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 PRPH2P23942 346 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 RASSF2P50749 326 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 POLE2P56282 527 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 AP2B1P63010 937 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ICA1Q05084 483 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 GAD2Q05329 585 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 FOXO1Q12778 655 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 MORC3Q14149 939 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 DCTN1Q14203 1278 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 GALNT3Q14435 633 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ENTPD8Q5MY95 495 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 KLBQ86Z14 1044 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM199Q8N511 208 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 KDM1BQ8NB78 822 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 LPAR1Q92633 364 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 MAGEH1Q9H213 219 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 Q9N2J8 555 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 PLCB1Q9NQ66 1216 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 RCE1Q9Y256 329 aa3.68□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 H0YGN5 161 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 GRM8O00222 908 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 NGFRP08138 427 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 RFX2P48378 723 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 PMPCAQ10713 525 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 PKP1Q13835 747 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 Q5PR19 223 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 C9orf50Q5SZB4 431 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 GGT6Q6P531 493 aa3.67□□□□□ -1.82
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms