RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 CHRNB1P11230 501 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ACVRL1P37023 503 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 TNFRSF4P43489 277 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 NDST2P52849 883 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 PARP15Q460N3 678 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 LZTR1Q8N653 840 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 CARD9Q9H257 536 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.44■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.44■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.44■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 RASA4O43374 803 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ZMPSTE24O75844 475 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 GNG11P61952 73 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 GBE1Q04446 702 aa20.43■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 BBS12Q6ZW61 710 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 CCDC105Q8IYK2 499 aa20.43■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 PJA1Q8NG27 643 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 HMCESQ96FZ2 354 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 NELL2Q99435 816 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 OSBPL8Q9BZF1 889 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 MUC3BQ9H195 1237 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.43■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 M0R296 226 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 APOL1O14791 398 aa20.42■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 NUMBP49757 651 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 TFDP2Q14188 446 aa20.42■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 RFX6Q8HWS3 928 aa20.42■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 FAM170BA6NMN3 283 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 KCNK3O14649 394 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 TIMM44O43615 452 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 SNAP91O60641 907 aa20.41■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 GLDCP23378 1020 aa20.41■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 SERINC3Q13530 473 aa20.41■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.41■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.41■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.41■□□□□ 0.86
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ACTB-210ENST00000477812 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ARF5P84085 180 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ENPP2Q13822 863 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 KAZNQ674X7 775 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 Q6ZS52 159 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 USP33Q8TEY7 942 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 ACDQ96AP0 544 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 OLFM3Q96PB7 478 aa20.4■□□□□ 0.86
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