RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468253.1

NPHP4-206, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 2

Gene NPHP4, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-206ENST00000468253 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.54■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 RAD54BQ9Y620 910 aa20.54■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 GPR179Q6PRD1 2367 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 ATP9BO43861 1147 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 PROSCO94903 275 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 P2RY2P41231 377 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 MAGEA1P43355 309 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 GNA12Q03113 381 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 ZBTB16Q05516 673 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 PGBD3Q8N328 593 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 SLC35G2Q8TBE7 412 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 PEBP4Q96S96 227 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 A0A0D9SEW6 157 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 NDUFV2P19404 249 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 SPA17Q15506 151 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 C9orf64Q5T6V5 341 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 CEP68Q76N32 757 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 LOXL4Q96JB6 756 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 BTBD6Q96KE9 485 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 PSMB7Q99436 277 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 RAB23Q9ULC3 237 aa20.52■□□□□ 0.88
NPHP4-206ENST00000468253 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 PRR23AA6NEV1 266 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 CREB3O43889 395 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 ZMPSTE24O75844 475 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 HLA-EP13747 358 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 IL1R2P27930 398 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 MAN1A1P33908 653 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 CLCN6P51797 869 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 COPAP53621 1224 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 DPYSL2Q16555 572 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 RETSATQ6NUM9 610 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 FRS2Q8WU20 508 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 RFFLQ8WZ73 363 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 TTC34A8MYJ7 566 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 RAMP2O60895 175 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 RHOBTB1O94844 696 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 TPI1P60174 286 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 CA9Q16790 459 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 OR7D4Q8NG98 312 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 PTPRN2Q92932 1015 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SPACA7Q96KW9 195 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SPON2Q9BUD6 331 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 DNAI1Q9UI46 699 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 VPS51Q9UID3 782 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SCML1Q9UN30 329 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 DMDP11532 3685 aa20.5■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 NDUFA10O95299 355 aa20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 IGLV3-19P01714 112 aa20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 RARAP10276 462 aa20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 OXTRP30559 389 aa20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 NDST2P52849 883 aa20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 DLG2Q15700 870 aa20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 PARP15Q460N3 678 aa20.49■□□□□ 0.87
NPHP4-206ENST00000468253 PLK5Q496M5 336 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms