RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SHC3Q92529 594 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP36Q96G28 342 aa8.58□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR18Q9BV38 432 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.58□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.58□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GUCY1B2O75343 617 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT75O95678 551 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MXI1P50539 228 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TPTEP56180 551 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PTP4A2Q12974 167 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf42Q96LP6 360 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 OLFM1Q99784 485 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PARVGQ9HBI0 331 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB20Q9NX57 234 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB14O43829 449 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GMNNO75496 209 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO1DO94832 1006 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN2P17706 415 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 GRM5P41594 1212 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 MFAP3P55082 362 aa8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 PMS2P3Q13401 168 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 IKBKEQ14164 716 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 C16orf46Q6P387 395 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 USP43Q70EL4 1123 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 PALMDQ9NP74 551 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 FAM189A1O60320 539 aa8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRT37O76014 449 aa8.57□□□□□ -1.04
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RABGEF1-203ENST00000439720 OTUD5Q96G74 571 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CAPNS2Q96L46 248 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF597Q96LX8 424 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.57□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 CPQQ9Y646 472 aa8.57□□□□□ -1.04
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