RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 NUMBP49757 651 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PDK4Q16654 411 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ALFQ53S48 1182 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 LZTR1Q8N653 840 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 APOPT1Q96IL0 206 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf74Q96LT6 269 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 TSGA13Q96PP4 275 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CWH43Q9H720 699 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 LAMA3Q16787 3333 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH1A2O94788 518 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ERVK-10P10266 1014 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 USP41Q3LFD5 358 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 RAP1GAP2Q684P5 730 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CASS4Q9NQ75 786 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PSAT1Q9Y617 370 aa23.7■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 TLR5O60602 858 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SPRED3Q2MJR0 410 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 LGSNQ5TDP6 509 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC121Q6ZUS5 278 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 IGSF21Q96ID5 467 aa23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 KRT38O76015 456 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 OAS1P00973 400 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 POLBP06746 335 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SLC18A2Q05940 514 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF683Q8IZ20 524 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC8CQ8TDW0 803 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 IGSF8Q969P0 613 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 TOX2Q96NM4 488 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 BFARQ9NZS9 450 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 GGT7Q9UJ14 662 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 TBX21Q9UL17 535 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 TM9SF1O15321 606 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 RFPL1O75677 317 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PSEN1P49768 467 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 NEK3P51956 506 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SMARCB1Q12824 385 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA21Q7Z572 469 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 TTC17Q96AE7 1141 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 NAT9Q9BTE0 207 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 MTRRQ9UBK8 725 aa23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC78A2IDD5 438 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 COPEO14579 308 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 MATN3O15232 486 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 LIG3P49916 1009 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF33AQ06730 810 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 NIPAL4Q0D2K0 466 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PRPSAP1Q14558 356 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 AFMIDQ63HM1 303 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 FBXL22Q6P050 247 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CCNJLQ8IV13 435 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 BTN2A3PQ96KV6 586 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ZYG11BQ9C0D3 744 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 DOCK4Q8N1I0 1966 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 HLA-DQB2P05538 268 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ITIH4Q14624 930 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 RASSF3Q86WH2 238 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC40Q9H9A6 602 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 PCMTD2Q9NV79 361 aa23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 BPTFQ12830 3046 aa23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 KCNQ1P51787 676 aa23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CYS1Q717R9 158 aa23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 IPMKQ8NFU5 416 aa23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 CDKL2Q92772 493 aa23.66■■□□□ 1.38
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD3Q96ES6 412 aa23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms