RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TPSAB1Q15661 275 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 INSCQ1MX18 579 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ELMOD1Q8N336 334 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 LGMNQ99538 433 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 RMND5AQ9H871 391 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CXCL11O14625 94 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 VPS4BO75351 444 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SERPINF2P08697 491 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 MLNP12872 115 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO32Q969P5 355 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 FOPNLQ96NB1 174 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 C5orf58C9J3I9 102 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CABYRO75952 493 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CYBBP04839 570 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 UQCRBP14927 111 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC7BQ86TV6 843 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 XYLT1Q86Y38 959 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 LGALS2P05162 132 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TUBP50607 506 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ADARP55265 1226 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 LIPMQ5VYY2 423 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PIGZQ86VD9 579 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TNS4Q8IZW8 715 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 DAW1Q8N136 415 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PNPOQ9NVS9 261 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.66■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SYTL3Q4VX76 610 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 MYO1HQ8N1T3 1032 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 S100A14Q9HCY8 104 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 LRRC37A3O60309 1634 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SNED1Q8TER0 1413 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF839A8K0R7 811 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 EFEMP1Q12805 493 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPAN14Q8NG11 270 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH19Q9H159 772 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R13Q9NYV9 303 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 OR12D3Q9UGF7 316 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 NPR3P17342 541 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 NFKB1P19838 968 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP2C18P33260 490 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 FOLH1Q04609 750 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SQLEQ14534 574 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ISLR2Q6UXK2 745 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PLD5Q8N7P1 536 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 RCN3Q96D15 328 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PIK3R1P27986 724 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 EPHA3P29320 983 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP6V1E1P36543 226 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 RTKNQ9BST9 563 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CLPBQ9H078 707 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 SLIT2O94813 1529 aa16.65■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa16.64■□□□□ 0.26
CTDSP2-201ENST00000398073 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ADSSP30520 456 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OXCT1P55809 520 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAF2Q12933 501 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 BANPQ8N9N5 519 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GLMNQ92990 594 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SPAG4Q9NPE6 437 aa16.64■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms