RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373212.5

SH3BGRL-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL-201ENST00000373212 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 KRT73Q86Y46 540 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 MDM1Q8TC05 714 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CPT1BQ92523 772 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 TBC1D5Q92609 795 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 KCNN1Q92952 543 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 BORCS6Q96GS4 357 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PACSIN1Q9BY11 444 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 S1PR5Q9H228 398 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 XPR1Q9UBH6 696 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 J3KTA2 159 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 VWA5AO00534 786 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PSPNO60542 156 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 TSPAN9O75954 239 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 DNAJB1P25685 340 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 SERPINA4P29622 427 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CRHR1P34998 444 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 HADHAP40939 763 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PTGISQ16647 500 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 NFIL3Q16649 462 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 SZRD1Q7Z422 152 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 SVOPQ8N4V2 548 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 KCTD6Q8NC69 237 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 IRF7Q92985 503 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 TOP1MTQ969P6 601 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 NEK1Q96PY6 1258 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CA14Q9ULX7 337 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 MTSS1O43312 755 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 TSPAN3O60637 253 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ALDH1A2O94788 518 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 IL18BPO95998 194 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 VIPP01282 170 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CYBBP04839 570 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ABCD1P33897 745 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ATP6V1E1P36543 226 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 STAT5BP51692 787 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 STILQ15468 1287 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 TTC22Q5TAA0 569 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 AFMIDQ63HM1 303 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 FCRL6Q6DN72 434 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 BRF2Q9HAW0 419 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ING3Q9NXR8 418 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 RAXQ9Y2V3 346 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 RIPK3Q9Y572 518 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 FRYLO94915 3013 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 FOCADQ5VW36 1801 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 WDR46O15213 610 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 TGDSO95455 350 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 IL11P20809 199 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 ADORA1P30542 326 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CD96P40200 585 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PIK3CAP42336 1068 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 PPARDQ03181 441 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 CHRNEQ04844 493 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BGRL-201ENST00000373212 SEC23BQ15437 767 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms