RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CES5AQ6NT32 575 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CHST9Q7L1S5 443 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 FBXO25Q8TCJ0 367 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 WFDC5Q8TCV5 224 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 S1PR5Q9H228 398 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 LINC00597Q9H2U6 94 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ZMYM5Q9UJ78 669 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.2■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 A0A0A0MRY4 1105 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CCDC151A5D8V7 595 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 H0Y626 953 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 J3KR12 359 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 MAFKO60675 156 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ERLIN1O75477 346 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ZNF567Q8N184 647 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CPXM2Q8N436 756 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 LRRC45Q96CN5 670 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 SPATA13Q96N96 652 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 SPON2Q9BUD6 331 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 BRD8Q9H0E9 1235 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 SP110Q9HB58 689 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 DONSONQ9NYP3 566 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 WHRNQ9P202 907 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 PAK5Q9P286 719 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 C5orf60A6NFR6 353 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CHKAP35790 457 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 LTBRP36941 435 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 GNA12Q03113 381 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 FSCBQ5H9T9 825 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ATAT1Q5SQI0 421 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 C6orf118Q5T5N4 469 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ART4Q93070 314 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 PWWP2AQ96N64 755 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ASB16Q96NS5 453 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TP73O15350 636 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 GCATO75600 419 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 METTL18O95568 372 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 JCHAINP01591 159 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CCNCP24863 283 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CDH18Q13634 790 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 PARP15Q460N3 678 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 MPPE1Q53F39 396 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ANKRD22Q5VYY1 191 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 IL31Q6EBC2 164 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TMEM25Q86YD3 366 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 MFN1Q8IWA4 741 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 SMARCD2Q92925 531 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 AGAP3Q96P47 875 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TSGA13Q96PP4 275 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 MYADMQ96S97 322 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 MUC3BQ9H195 1237 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CLEC4EQ9ULY5 219 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 GOLGA8MH3BSY2 632 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ITIH2P19823 946 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 GLDCP23378 1020 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 SP100P23497 879 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 SERINC3Q13530 473 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 PID1Q7Z2X4 250 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CPT1BQ92523 772 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 FMO2Q99518 471 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 KIF9Q9HAQ2 790 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 CDH7Q9ULB5 785 aa18.17■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa18.16■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa18.16■□□□□ 0.5
LTV1-201ENST00000367576 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms