RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-201ENST00000366959 HGH1Q9BTY7 390 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRRC19Q9H756 370 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 PEX11AO75192 247 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 ATP6AP2O75787 350 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 NCKAP1LP55160 1127 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 FGD2Q7Z6J4 655 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 LUZP2Q86TE4 346 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 FBXO30Q8TB52 745 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 A0A0A0MRY4 1105 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 TGFB1I1O43294 461 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 LGALS2P05162 132 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 PARP6Q2NL67 630 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 EID3Q8N140 333 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 C12orf29Q8N999 325 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPATA13Q96N96 652 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 LGMNQ99538 433 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 NDNQ99608 321 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 ERVK-5Q9HDB9 667 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.53□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 MOXD2PA6NHM9 499 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 GRIN3BO60391 1043 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC166P0CW27 439 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 FSTL1Q12841 308 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 MFSD10Q14728 455 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 UGCGQ16739 394 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF621Q6ZSS3 439 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 SENP8Q96LD8 212 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 YME1L1Q96TA2 773 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 TNFRSF8P28908 595 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 GRIA3P42263 894 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDK4Q16654 411 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 ITFG1Q8TB96 612 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 RORBQ92753 470 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 C2CD2Q9Y426 696 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.52□□□□□ -0.08
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAD51BO15315 384 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 B4GALT5O43286 388 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SREBF2Q12772 1141 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 XRCC4Q13426 336 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ACAP1Q15027 740 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 COPG2Q9UBF2 871 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PTPRAP18433 802 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 WNT8BQ93098 351 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 LRRC39Q96DD0 335 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CERS2Q96G23 380 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RNF157Q96PX1 679 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SYBUQ9NX95 663 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PIPSLA2A3N6 862 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PIRTP0C851 137 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SCNN1GP51170 649 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 BFSP2Q13515 415 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 SDE2Q6IQ49 451 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 RETSATQ6NUM9 610 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 HDDC2Q7Z4H3 204 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 OOSP2Q86WS3 158 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 STMN3Q9NZ72 180 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa14.52□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.51□□□□□ -0.09
RPS6KC1-201ENST00000366959 H3BN98 237 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms