RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM16LQ309B1 348 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SNX32Q86XE0 403 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 HES2Q9Y543 173 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC154A6NI56 674 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ATP9AO75110 1047 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RPN2P04844 631 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 IL31RAQ8NI17 732 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 OPTCQ9UBM4 332 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB22O15209 634 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 GPSM1Q86YR5 675 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PRELID2Q8N945 189 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 WDR48Q8TAF3 677 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FIG4Q92562 907 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC167Q9P0B6 97 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CRYL1Q9Y2S2 319 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0B4J269 797 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GW55 424 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DUX4L2P0CJ85 424 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DUX4L3P0CJ86 424 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DUX4L4P0CJ87 422 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DUX4L5P0CJ88 424 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DUX4L6P0CJ89 424 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DUX4L7P0CJ90 424 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PSEN1P49768 467 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NOMO3P69849 1222 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 AADACL2Q6P093 401 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 REPS1Q96D71 796 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ARMCX1Q9P291 453 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DUX4Q9UBX2 424 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 LYPLA2O95372 231 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 BMP10O95393 424 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FMO4P31512 558 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 IL17AQ16552 155 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF670Q9BS34 389 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.6■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RPL14P50914 215 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 C1DQ13901 141 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 USP6NLQ92738 828 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 POMKQ9H5K3 350 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 IKBKEQ14164 716 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 HGH1Q9BTY7 390 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PALMDQ9NP74 551 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MAP2K7O14733 419 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CATP04040 527 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ATP4AP20648 1035 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ALLCQ8N6M5 410 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 GLMNQ92990 594 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CENPTQ96BT3 561 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SPG21Q9NZD8 308 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RGS14O43566 566 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ITGAVP06756 1048 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FAM58BPP0C7Q3 252 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TYMPP19971 482 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 GPR15P49685 360 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 HECTD3Q5T447 861 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 USP45Q70EL2 814 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 STARD8Q92502 1023 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SEMA4DQ92854 862 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CERS2Q96G23 380 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RNF208Q9H0X6 261 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.59■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DGKAP23743 735 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 IL5RAQ01344 420 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ACOX1Q15067 660 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CDRT15Q96T59 188 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MAN1C1Q9NR34 630 aa20.58■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD2P08910 425 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms