RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 TOP6BLQ8N6T0 577 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 DTX3LQ8TDB6 740 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ULBP1Q9BZM6 244 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 TMLHEQ9NVH6 421 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX10Q9Y5X0 201 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 POLBP06746 335 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SKIP12755 728 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 NUMBP49757 651 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBP50607 506 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE1BQ01064 536 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 NOGQ13253 232 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG14Q6ZNE5 492 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 RFX8Q6ZV50 586 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF280BQ86YH2 543 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 B3GALT6Q96L58 329 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC4Q9HBW1 653 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 CREBZFQ9NS37 354 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PIGVQ9NUD9 493 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 STAP1Q9ULZ2 295 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR182O15218 404 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINE1P05121 402 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVK-10P10266 1014 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 BDNFP23560 247 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAL1Q4LDG9 190 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PPM1JQ5JR12 505 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 CERS2Q96G23 380 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SMOQ99835 787 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 UNC80Q8N2C7 3258 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 UPP2O95045 317 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SPANXN3Q5MJ09 141 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 RABGAP1LQ5R372 815 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM154Q6P9G4 183 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 RASSF3Q86WH2 238 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 C10orf107Q8IVU9 208 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ZMIZ2Q8NF64 920 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ANLNQ9NQW6 1124 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 LRPAP1P30533 357 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 GP5P40197 560 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PBX3P40426 434 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 DEUP1Q05D60 604 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 IRF5Q13568 498 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 UPP1Q16831 310 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SDHAF4Q5VUM1 108 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 CES3Q6UWW8 571 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PID1Q7Z2X4 250 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ULK2Q8IYT8 1036 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SORT1Q99523 831 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 GORASP1Q9BQQ3 440 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM216Q9P0N5 145 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SRRDQ9UH36 339 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 FYNP06241 537 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 GRK2P25098 689 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 CPOXP36551 454 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 GRTP1Q5TC63 336 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRTM3Q86VH5 581 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PPFIBP2Q8ND30 876 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 UCMAQ8WVF2 138 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 CLPTM1LQ96KA5 538 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC9A7Q96T83 725 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 CPNE1Q99829 537 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 THTPAQ9BU02 230 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM72CH0Y354 149 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 TYK2P29597 1187 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ADRA1BP35368 520 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEA12P43365 314 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 GATMP50440 423 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM72AQ5TYM5 149 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM72DQ6L9T8 149 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 MAVSQ7Z434 540 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM72BQ86X60 149 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ISL2Q96A47 359 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PANX3Q96QZ0 392 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 RTP3Q9BQQ7 232 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 YIPF3Q9GZM5 350 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 COPG2Q9UBF2 871 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 I6L893 689 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNK1O00180 336 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPN3P26045 913 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 ARRB2P32121 409 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 OLIG2Q13516 323 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM35AQ86V20 835 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52K1Q8NGK4 314 aa19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms