RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CD86P42081 329 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 STARD3Q14849 445 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 STK32AQ8WU08 396 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CASP10Q92851 521 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 PCDH18Q9HCL0 1135 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 SELENONQ9NZV5 590 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 B4GALT4O60513 344 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CCNB1P14635 433 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 A0A1W2PPM1 405 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 A8MX80 341 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 INPP4BO15327 924 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 ALG9Q9H6U8 611 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 RAD51BO15315 384 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 RAG1P15918 1043 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CD52P31358 61 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 PKNOX1P55347 436 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 PLD1Q13393 1074 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 LRRC57Q8N9N7 239 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 UNC5CO95185 931 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CLPTM1O96005 669 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 ARL4DP49703 201 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 UBE3AQ05086 875 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 RUNX1T1Q06455 604 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 TRAF2Q12933 501 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CRYMQ14894 314 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.85e-10■□□□□ 10.1
TMOD3-201ENST00000308580 SDHAF4Q5VUM1 108 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 TRABD2AQ86V40 505 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 OR56A4Q8NGH8 313 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 SH3GL1Q99961 368 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 C15orf41Q9Y2V0 281 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 DHFR2Q86XF0 187 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 GDPD5Q8WTR4 605 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 NSMCE2Q96MF7 247 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 PCNAP12004 261 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CKBP12277 381 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 DAB1O75553 588 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 TSHRP16473 764 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 KCNJ2P63252 427 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 VAC14Q08AM6 782 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 MTA1Q13330 715 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 GPR141Q7Z602 305 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 LHX5Q9H2C1 402 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CAPN10Q9HC96 672 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 KDM1AO60341 852 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CCDC166P0CW27 439 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 FASP25445 335 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CACNA2D1P54289 1103 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 BCL2L1Q07817 233 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 FAM35AQ86V20 835 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 SLC25A23Q9BV35 468 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM114B3SHH9 223 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 E7ENQ6 273 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 BRCC3P46736 316 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 JAM2P57087 298 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CNTN1Q12860 1018 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 DUSP28Q4G0W2 176 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CLEC4DQ8WXI8 215 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 ZMYM5Q9UJ78 669 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 WDR47O94967 919 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 PCYT1AP49585 367 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 NEK2P51955 445 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-201ENST00000308580 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms