RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 FAM110BQ8TC76 370 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RIT2Q99578 217 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CGREF1Q99674 301 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 VTA1Q9NP79 307 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 H0YJX3 145 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PSMD11O00231 422 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 KCNQ2O43526 872 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SNAP91O60641 907 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 METTL18O95568 372 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 KRT75O95678 551 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PRKCGP05129 697 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ERVK-10P10266 1014 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NAT1P18440 290 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 MATN1P21941 496 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CNTFP26441 200 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 DCKP27707 260 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 BCAR1P56945 870 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SPP2Q13103 211 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RAB6CQ53S08 254 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 GK5Q6ZS86 529 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 DPH6Q7L8W6 267 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TFAP2BQ92481 460 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ASB9Q96DX5 294 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 FBXL20Q96IG2 436 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ADI1Q9BV57 179 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CEP44Q9C0F1 390 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PI4KBQ9UBF8 816 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 SEPT3Q9UH03 358 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 VPS28Q9UK41 221 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CPQQ9Y646 472 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 C9IYK1 514 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 HDAC3O15379 428 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CLOCKO15516 846 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TRIM13O60858 407 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 LTFP02788 710 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 HMGCRP04035 888 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 IL1R1P14778 569 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 HDCP19113 662 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TFEBP19484 476 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TTKP33981 857 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 GRIA3P42263 894 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RAD23AP54725 363 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 NME5P56597 212 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ADAM17P78536 824 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TSPY1Q01534 308 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CXorf38Q8TB03 319 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 CEP170P1Q96L14 293 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 OLFM1Q99784 485 aa6.41□□□□□ -1.38
LRRN3-201ENST00000308478 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms