RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	PTGIR	P43119	386 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	MAPKAPK2	P49137	400 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	FNTA	P49354	379 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	GDF10	P55107	478 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	GALNT2	Q10471	571 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	GRM2	Q14416	872 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	MPPE1	Q53F39	396 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	IRF7	Q92985	503 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	OTUB2	Q96DC9	234 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421	COL4A3	Q01955	1670 aa		18.21	■□□□□ 0.51
SPIN3-238	ENST00000640421		A0A0D9SEW6	157 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	RAD51C	O43502	376 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LZTR1	Q8N653	840 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	HMCES	Q96FZ2	354 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421		H7C0C1	242 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	DFFA	O00273	331 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	TTI1	O43156	1089 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	CYP17A1	P05093	508 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	VAV1	P15498	845 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ACVRL1	P37023	503 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ATP5O	P48047	213 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	TNK2	Q07912	1038 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	HTR4	Q13639	388 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	TEX35	Q5T0J7	233 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	MPP7	Q5T2T1	576 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	EBF3	Q9H4W6	596 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	USP29	Q9HBJ7	922 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		18.2	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	RASA4B	C9J798	803 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	RASA4	O43374	803 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	RAMP2	O60895	175 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ITGAV	P06756	1048 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	RBL1	P28749	1068 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	NDST2	P52849	883 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	TFF2	Q03403	129 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	XRCC4	Q13426	336 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	PDK1	Q15118	436 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	DHCR24	Q15392	516 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	OR7D4	Q8NG98	312 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC114	Q96M63	670 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	BBS2	Q9BXC9	721 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	EPC1	Q9H2F5	836 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	HPS4	Q9NQG7	708 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	RAD54B	Q9Y620	910 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ANHX	E9PGG2	379 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421		H0Y626	953 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	MAFK	O60675	156 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	TYR	P14679	529 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	IFNAR2	P48551	515 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	DR1	Q01658	176 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ANO4	Q32M45	955 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	MFN1	Q8IWA4	741 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ALLC	Q8N6M5	410 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	CCNY	Q8ND76	341 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	ATL2	Q8NHH9	583 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	E2F7	Q96AV8	911 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	HDAC11	Q96DB2	347 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	HINFP	Q9BQA5	517 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SPIN3-238	ENST00000640421	MARK1	Q9P0L2	795 aa		18.18	■□□□□ 0.5

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