RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 BBS5Q8N3I7 341 aa20.95■□□□□ 0.94
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PMS1-222ENST00000639501 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.95■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 CNDP1Q96KN2 507 aa20.95■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 PLOD2O00469 737 aa20.94■□□□□ 0.94
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PMS1-222ENST00000639501 ITGA7Q13683 1181 aa20.94■□□□□ 0.94
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PMS1-222ENST00000639501 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.94■□□□□ 0.94
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PMS1-222ENST00000639501 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 H3BNH8 94 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 PFKMP08237 780 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
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PMS1-222ENST00000639501 MAGEA12P43365 314 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 IKBKEQ14164 716 aa20.91■□□□□ 0.94
PMS1-222ENST00000639501 LZTR1Q8N653 840 aa20.91■□□□□ 0.94
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