RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-208ENST00000638372 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PACS2Q86VP3 889 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TEKT4Q8WW24 435 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SIX2Q9NPC8 291 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CILPO75339 1184 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ALBP02768 609 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CRABP2P29373 138 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MON1BQ7L1V2 547 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FAM35AQ86V20 835 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SNX32Q86XE0 403 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TEX12Q9BXU0 123 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 LHX5Q9H2C1 402 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa14.62□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 IYDQ6PHW0 289 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CENPTQ96BT3 561 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 EXOC2Q96KP1 924 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TBC1D4O60343 1298 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FMO4P31512 558 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 HALP42357 657 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ANKS6Q68DC2 871 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TNS4Q8IZW8 715 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF786Q8N393 782 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 P2RY11Q96G91 374 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DUSP16Q9BY84 665 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SEPT3Q9UH03 358 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SNED1Q8TER0 1413 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MMP3P08254 477 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 EPB42P16452 691 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PEX5P50542 639 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 INHBEP58166 350 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CACUL1Q86Y37 369 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 BTN3A1O00481 513 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ABHD2P08910 425 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DRD4P21917 467 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PMF1Q6P1K2 205 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 XYLT1Q86Y38 959 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MPP6Q9NZW5 540 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.61□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CD48P09326 243 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CHRNB2P17787 502 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 KLRC2P26717 231 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 FAM110CQ1W6H9 321 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 RGMBQ6NW40 437 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TRABD2AQ86V40 505 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 OMDQ99983 421 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PDZD7Q9H5P4 517 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NFKBIEO00221 500 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PRIM2P49643 509 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PDK4Q16654 411 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 PCID2Q5JVF3 399 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 HORMAD1Q86X24 394 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 METTL6Q8TCB7 284 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 POMKQ9H5K3 350 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.6□□□□□ -0.07
SCARB2-208ENST00000638372 CDK7P50613 346 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms