RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		27.86	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		27.86	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		27.86	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		27.86	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A1W2PP55	124 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	CLDN11	O75508	207 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	F9	P00740	461 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	PROS1	P07225	676 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC8A1	P32418	973 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	GABRB2	P47870	512 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	HLA-B	Q31612	363 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	ERICH1	Q86X53	443 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	NPY6R	Q99463	290 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	WDCP	Q9H6R7	721 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		27.85	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A1B0GVT2	93 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	PAGE1	O75459	146 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SPINK2	P20155	84 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	C5AR1	P21730	350 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SULT1E1	P49888	294 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	CENPC	Q03188	943 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPRN2	Q92932	1015 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	IGSF8	Q969P0	613 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	STK33	Q9BYT3	514 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	PSMD8	P48556	350 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	CDH4	P55283	916 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	BNC1	Q01954	994 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	STK40	Q8N2I9	435 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	SPAG5	Q96R06	1193 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM129B	Q96TA1	746 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	PIGV	Q9NUD9	493 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	VPS28	Q9UK41	221 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM131	Q92545	1883 aa		27.83	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007		F8VZ95	297 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	FLRT2	O43155	660 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	IL1B	P01584	269 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	IGHV4-34	P06331	123 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	GOT1	P17174	413 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	CXCR3	P49682	368 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	GALC	P54803	685 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM193A	P78312	1265 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	DEUP1	Q05D60	604 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	C5orf22	Q49AR2	442 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	TAF3	Q5VWG9	929 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF677	Q86XU0	584 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	SKA1	Q96BD8	255 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	SIK2	Q9H0K1	926 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	IL21R	Q9HBE5	538 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	PLXNA2	O75051	1894 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	USP24	Q9UPU5	2620 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A1W2PPC4	97 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	KIF19	Q2TAC6	998 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	LRRC31	Q6UY01	552 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	XYLT1	Q86Y38	959 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	NT5C3B	Q969T7	300 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	GBP4	Q96PP9	640 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		27.81	■■■□□ 2.04
LYNX1-208	ENST00000615007	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04

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