RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 CORO1BQ9BR76 489 aa9.06□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM107BQ9H098 131 aa9.06□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.06□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.06□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 MSRAQ9UJ68 235 aa9.06□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CEP290O15078 2479 aa9.06□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 DFFAO00273 331 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 XYLBO75191 536 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 KLKB1P03952 638 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 EPCAMP16422 314 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 HDCP19113 662 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 FDFT1P37268 417 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 MAPKAPK2P49137 400 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 NDST2P52849 883 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC7A9P82251 487 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CYP4F8P98187 520 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 WASHC5Q12768 1159 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 KCNJ11Q14654 390 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ALFQ53S48 1182 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 RABGAP1LQ5R372 815 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TXNDC8Q6A555 127 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 DENND1CQ8IV53 801 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGSF8Q969P0 613 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 RUFY1Q96T51 708 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 VAT1Q99536 393 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ATXN3LQ9H3M9 355 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 LAMA3Q16787 3333 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 A0A1W2PRU2 124 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 KCNK1O00180 336 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 RFPL2O75678 378 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CNTN5O94779 1100 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM63AO94886 807 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CKMP06732 381 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 IRF1P10914 325 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 MYL4P12829 197 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCNCP24863 283 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 PTPN3P26045 913 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.967e-14■□□□□ 11.3
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC6A4P31645 630 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 MAGEA9P43362 315 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 IRAK1P51617 712 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARL4CP56559 192 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SEMA5AQ13591 1074 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 HIF1AQ16665 826 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ADGRF1Q5T601 910 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CENPUQ71F23 418 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SRLQ86TD4 932 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 LGI2Q8N0V4 545 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 IQCKQ8N0W5 287 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF567Q8N184 647 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 PPM1EQ8WY54 764 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 FATE1Q969F0 183 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZIM3Q96PE6 472 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC22A12Q96S37 553 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 GKN1Q9NS71 199 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 CPQQ9Y646 472 aa9.05□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.04□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.04□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.04□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 SOBPA7XYQ1 873 aa9.04□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 MAFKO60675 156 aa9.04□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAMP2O60895 175 aa9.04□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 APRTP07741 180 aa9.04□□□□□ -0.96
PRKAR1A-211ENST00000586397 NUDT17P0C025 328 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms