RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585714.1

ABCA9-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 4

Gene ABCA9, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-208	ENST00000585714	KLK15	Q9H2R5	256 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	RMI1	Q9H9A7	625 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	TMEM160	Q9NX00	188 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ABCA6	Q8N139	1617 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		5.77	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	HOXD12	P35452	270 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	STAT6	P42226	847 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	VAMP2	P63027	116 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	TRPC3	Q13507	836 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	DLGAP5	Q15398	846 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ESX1	Q8N693	406 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	TEX19	Q8NA77	164 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	NAXE	Q8NCW5	288 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	REEP2	Q9BRK0	252 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	COX11	Q9Y6N1	276 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SYNM	O15061	1565 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	GRM8	O00222	908 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	TSPAN3	O60637	253 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CSF1	P09603	554 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	XBP1	P17861	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CD38	P28907	300 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	VPS41	P49754	854 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ZNF84	P51523	738 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SLC37A1	P57057	533 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SLC14A1	Q13336	389 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	LINS1	Q8NG48	757 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	INSL6	Q9Y581	213 aa		5.75	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CYP2D6	P10635	497 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ACP5	P13686	325 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	PNPLA4	P41247	253 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	KRTAP10-11	P60412	298 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ATG16L1	Q676U5	607 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	GPR78	Q96P69	363 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	NUAK2	Q9H093	628 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	KIF14	Q15058	1648 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	KLK10	O43240	276 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	TNNT1	P13805	278 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CPA1	P15085	419 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SHC2	P98077	582 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CDK18	Q07002	472 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	DMWD	Q09019	674 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	MAPK7	Q13164	816 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	GPR162	Q16538	588 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	AWAT1	Q58HT5	328 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ANO7	Q6IWH7	933 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	HTRA1	Q92743	480 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	HVCN1	Q96D96	273 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ABCA9-208	ENST00000585714	MPP4	Q96JB8	637 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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