RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A087X0B3	334 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MDM4	O15151	490 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP26A1	O43174	497 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJA2	O60884	412 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LEFTY1	O75610	366 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GCNT3	O95395	438 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TBX18	O95935	607 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PFKL	P17858	780 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ANXA13	P27216	316 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ITPKB	P27987	946 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PCSK1	P29120	753 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NTSR1	P30989	418 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HOXD13	P35453	343 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TNFRSF4	P43489	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KIR3DL1	P43629	444 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	LHX1	P48742	406 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC5A3	P53794	718 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF4	P78317	190 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GAD2	Q05329	585 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CYP4F3	Q08477	520 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ANO4	Q32M45	955 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FUT11	Q495W5	492 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	AK8	Q96MA6	479 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNK16	Q96T55	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GABRG3	Q99928	467 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	RELN	P78509	3460 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A087WV48	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1B0GVT2	93 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	MEI4	A8MW99	385 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	CBX4	O00257	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PTPRM-206	ENST00000578093	PLK4	O00444	970 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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