RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565236.1

CLN3-215, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 3

Gene CLN3, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-215ENST00000565236 OMDQ99983 421 aa23.15■■□□□ 1.3
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CLN3-215ENST00000565236 KNL1Q8NG31 2342 aa23.15■■□□□ 1.3
CLN3-215ENST00000565236 CACNA1BQ00975 2339 aa23.14■■□□□ 1.3
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CLN3-215ENST00000565236 FAM47DPA6NHR8 397 aa23.14■■□□□ 1.29
CLN3-215ENST00000565236 MID1O15344 667 aa23.14■■□□□ 1.29
CLN3-215ENST00000565236 SH3BP5O60239 455 aa23.14■■□□□ 1.29
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CLN3-215ENST00000565236 SLC8A1P32418 973 aa23.14■■□□□ 1.29
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CLN3-215ENST00000565236 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.14■■□□□ 1.29
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CLN3-215ENST00000565236 C14orf80Q86SX3 495 aa23.14■■□□□ 1.29
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CLN3-215ENST00000565236 FEM1AQ9BSK4 669 aa23.14■■□□□ 1.29
CLN3-215ENST00000565236 TKTL2Q9H0I9 626 aa23.14■■□□□ 1.29
CLN3-215ENST00000565236 GAREM1Q9H706 876 aa23.14■■□□□ 1.29
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CLN3-215ENST00000565236 A0A1W2PP55 124 aa23.13■■□□□ 1.29
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CLN3-215ENST00000565236 VPS28Q9UK41 221 aa23.12■■□□□ 1.29
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CLN3-215ENST00000565236 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa23.11■■□□□ 1.29
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CLN3-215ENST00000565236 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa23.11■■□□□ 1.29
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