RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KNL1Q8NG31 2342 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 E5RJQ4 531 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MID1O15344 667 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 DKK1O94907 266 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ADH1BP00325 375 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 IL1BP01584 269 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CD38P28907 300 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GNA15P30679 374 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CCR1P32246 355 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PLK1P53350 603 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MTA1Q13330 715 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CCDC157Q569K6 752 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 LAYNQ6UX15 382 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 APCDD1Q8J025 514 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 STK40Q8N2I9 435 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PTPRN2Q92932 1015 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 NOX5Q96PH1 765 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CRACR2AQ9BSW2 395 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ATRXP46100 2492 aa8.42□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GTQ1 180 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TRABD2BA6NFA1 517 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TLR4O00206 839 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 YKT6O15498 198 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 IGLV3-25P01717 112 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ITGAVP06756 1048 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GLI1P08151 1106 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CDK4P11802 303 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PDGFRAP16234 1089 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KRT9P35527 623 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PSMD8P48556 350 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 IL9RQ01113 521 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PTK2Q05397 1052 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PDCLQ13371 301 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 KCNJ12Q14500 433 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TAF5Q15542 800 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ACCSLQ4AC99 568 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TRIM65Q6PJ69 517 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 DEFB106AQ8N104 65 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MDM1Q8TC05 714 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SERAC1Q96JX3 654 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SLC6A18Q96N87 628 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SPAG5Q96R06 1193 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 EBF2Q9HAK2 575 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GDF3Q9NR23 364 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 DDIT4Q9NX09 232 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.41□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GVM2 712 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PR77 199 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MAGEC1O60732 1142 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 HSF2BPO75031 334 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 CLDN11O75508 207 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 WNT1P04628 370 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 C1SP09871 688 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 JUPP14923 745 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 ZNF18P17022 549 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 SLC9A1P19634 815 aa8.4□□□□□ -1.06
COCH-211ENST00000557065 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms