RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555907.5

RAD51B-222, Transcript of RAD51 paralog B, human

TSL 5

Gene RAD51B, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51B-222	ENST00000555907	ARHGAP8	P85298	464 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	USP4	Q13107	963 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	DPYS	Q14117	519 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	ZNF77	Q15935	545 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	C14orf80	Q86SX3	495 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	NELL2	Q99435	816 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	PSMB7	Q99436	277 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	RTKN	Q9BST9	563 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	STIM2	Q9P246	746 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	RAB23	Q9ULC3	237 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RAD51B-222	ENST00000555907		E9PAM4	449 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	DCLK1	O15075	740 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	ZNF185	O15231	689 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	RHOQ	P17081	205 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	GOT1	P17174	413 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	TACR2	P21452	398 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	GJC1	P36383	396 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	PAFAH1B1	P43034	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	MTAP	Q13126	283 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	MPP7	Q5T2T1	576 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	RNF43	Q68DV7	783 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	PQLC3	Q8N755	202 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	CALN1	Q9BXU9	219 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907		F5H5T6	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	CHAD	O15335	359 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	NCAM2	O15394	837 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	CREB3	O43889	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	FGG	P02679	453 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	ADRB1	P08588	477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	IRF1	P10914	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	ERCC2	P18074	760 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	SLC6A4	P31645	630 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	NR2C2	P49116	596 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	TPI1	P60174	286 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	NLRP14	Q86W24	1093 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	CHSY1	Q86X52	802 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD51B-222	ENST00000555907	RIN3	Q8TB24	985 aa		11.63	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms