RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PNLIPRP1P54315 467 aa8.66□□□□□ -1.02
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PTPRB-208ENST00000550358 KCNA3P22001 575 aa8.65□□□□□ -1.02
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PTPRB-208ENST00000550358 ITGA1P56199 1179 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC19Q9H756 370 aa8.65□□□□□ -1.02
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