RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CR2P20023 1033 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 COMTP21964 271 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 PRKAR1BP31321 381 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 HSD17B2P37059 387 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ADCY8P40145 1251 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 MASP1P48740 699 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 DNM2P50570 870 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 STIM1Q13586 685 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R7Q15435 360 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 TBR1Q16650 682 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 TM4SF20Q53R12 229 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 EFHBQ8N7U6 833 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 GSTCDQ8NEC7 633 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 HVCN1Q96D96 273 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 SPATA33Q96N06 139 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 FSD1Q9BTV5 496 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CPVLQ9H3G5 476 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 PXMP2Q9NR77 195 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 TLR9Q9NR96 1032 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.2□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 PRR23AA6NEV1 266 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 GGPS1O95749 300 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 RHOXF2BP0C7M4 288 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 GOLGA8HP0CJ92 632 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 DNAJB1P25685 340 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ICAM3P32942 547 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ATP6V1E1P36543 226 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 MTHFRP42898 656 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 SP2Q02086 613 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 VPS53Q5VIR6 699 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 AGBL4Q5VU57 503 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 KANK2Q63ZY3 851 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 AADATQ8N5Z0 425 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CFHR4Q92496 578 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 P2RX5Q93086 422 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 TTPALQ9BTX7 342 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 BTBD2Q9BX70 525 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CD93Q9NPY3 652 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 NR2E1Q9Y466 385 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CEP250Q9BV73 2442 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CCDC171Q6TFL3 1326 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ARHGAP6O43182 974 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 DAB1O75553 588 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 RPS6KA5O75582 802 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 LGALS2P05162 132 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ITGB1P05556 798 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 NBL1P41271 181 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ASMTP46597 345 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 LIMK1P53667 647 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CDK17Q00537 523 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 GHRHRQ02643 423 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 PTPN21Q16825 1174 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 MZT2BQ6NZ67 158 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZSN1 163 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 NLRP14Q86W24 1093 aa8.19□□□□□ -1.1
LMO3-212ENST00000535535 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms