RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 RAI2Q9Y5P3 530 aa11.95□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 MYLKQ15746 1914 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 M0QYV0 167 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PIK3R2O00459 728 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 C1QL1O75973 258 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PAEPP09466 180 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF18P17022 549 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ACP1P24666 158 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 TMPRSS3P57727 454 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CETN1Q12798 172 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 BNIP3Q12983 259 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 KCNJ12Q14500 433 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 MS4A13Q5J8X5 152 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 SFMBT2Q5VUG0 894 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM270Q6UE05 265 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CHSY1Q86X52 802 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CFAP52Q8N1V2 620 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF843Q8N446 348 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 AADATQ8N5Z0 425 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 RFFLQ8WZ73 363 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 RNF34Q969K3 372 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 EEF2KMTQ96G04 330 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 MRGPRX3Q96LB0 322 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 HSFY1Q96LI6 401 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 SPATA32Q96LK8 384 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 MIS12Q9H081 205 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 EBF2Q9HAK2 575 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.94□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF462Q96JM2 2506 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 F5H5T6 163 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 J3QKU1 62 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 LATO43561 262 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 MT-CO3P00414 261 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 KRT85P78386 507 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 RHDQ02161 417 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 TLE3Q04726 772 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 KCNH2Q12809 1159 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 DPYDQ12882 1025 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 LRMPQ12912 555 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ACCSLQ4AC99 568 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CBWD6Q4V339 395 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 DCAF6Q58WW2 860 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 LGI2Q8N0V4 545 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 SLC35F5Q8WV83 523 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 LMLNQ96KR4 655 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 NT5C1BQ96P26 610 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 FAM129BQ96TA1 746 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ST7Q9NRC1 585 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 RMND1Q9NWS8 449 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 HPSEQ9Y251 543 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 COQ4Q9Y3A0 265 aa11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 SDC3O75056 442 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PRR29P0C7W0 189 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ACADSBP45954 432 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PPP2CBP62714 309 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PPP2CAP67775 309 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 CNGA2Q16280 664 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ZCWPW2Q504Y3 356 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 FSCBQ5H9T9 825 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 NADSYN1Q6IA69 706 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PMF1Q6P1K2 205 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 TRIM69Q86WT6 500 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 PTPRN2Q92932 1015 aa11.92□□□□□ -0.5
CMTM1-211ENST00000528484 KLHDC7BQ96G42 594 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms