RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-208ENST00000524325 OR7D4Q8NG98 312 aa23.34■■□□□ 1.33
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TSNARE1-208ENST00000524325 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa23.3■■□□□ 1.32
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TSNARE1-208ENST00000524325 FIBINQ8TAL6 211 aa23.3■■□□□ 1.32
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TSNARE1-208ENST00000524325 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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TSNARE1-208ENST00000524325 TRIOO75962 3097 aa23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 H7C0C1 242 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 J3KR12 359 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 OPRD1P41143 372 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP5OP48047 213 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 NR1H3Q13133 447 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 TDGQ13569 410 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-208ENST00000524325 NOMO1Q15155 1222 aa23.28■■□□□ 1.32
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