RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	CEP290	O15078	2479 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM39-240	ENST00000495293	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	MASP2	O00187	686 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	OFD1	O75665	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	RFPL1	O75677	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	NDUFA10	O95299	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	LYPLA2	O95372	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	CD52	P31358	61 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	PLA2G5	P39877	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	UBA7	P41226	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	C21orf58	P58505	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ERVK-21	P61565	698 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	APBA1	Q02410	837 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	MGAT3	Q09327	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	LPIN1	Q14693	890 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293		Q6ZVL8	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	AK8	Q96MA6	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	RAD9A	Q99638	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	EVPL	Q92817	2033 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293		A0A087WZ62	844 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM150B	A6NC51	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	AKR1B10	O60218	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	GPR32	O75388	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	MED24	O75448	989 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ERLIN2	O94905	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	ABLIM3	O94929	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	GJB5	O95377	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	CA3	P07451	260 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	RARRES1	P49788	294 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	GPC3	P51654	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB103A	P81534	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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