RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 TTC17Q96AE7 1141 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ALG14Q96F25 216 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 MYO19Q96H55 970 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PHOX2BQ99453 314 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 GABRG3Q99928 467 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ZYG11BQ9C0D3 744 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CD248Q9HCU0 757 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 USP18Q9UMW8 372 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 R4GN57 208 aa8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PKP4-216ENST00000495123 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 A0A0D9SEW6 157 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 MYO1FO00160 1098 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 TIMM44O43615 452 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 CREB3O43889 395 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 LCA5LO95447 670 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 RHOCP08134 193 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 HLA-EP13747 358 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 L1CAMP32004 1257 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 PCK1P35558 622 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 MAGEA1P43355 309 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 AIF1P55008 147 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 NHLH1Q02575 133 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ACAP1Q15027 740 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ERMARDQ5T6L9 678 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ANO7Q6IWH7 933 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 RASSF3Q86WH2 238 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 CCDC170Q8IYT3 715 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ZNF366Q8N895 744 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 TSTD1Q8NFU3 115 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 PSMB7Q99436 277 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 TMEM245Q9H330 911 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 MTG2Q9H4K7 406 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ZWILCHQ9H900 591 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.89□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 NPC1O15118 1278 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 PRPSAP2O60256 369 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 SNAP91O60641 907 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 LILRB5O75023 590 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 PROSCO94903 275 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 NDUFA10O95299 355 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 MOCS3O95396 460 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 APBB3O95704 486 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ASLP04424 464 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 EPHX1P07099 455 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 RARAP10276 462 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 RHOQP17081 205 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 GABRG2P18507 467 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 GLDCP23378 1020 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 EPHB2P29323 1055 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 OR1E1P30953 314 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 HOXA6P31267 233 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 STK19P49842 368 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 DGKEP52429 567 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 PLK1P53350 603 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 OXCT1P55809 520 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 TAS2R40P59535 323 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 SLC12A1Q13621 1099 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 MESDQ14696 234 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.88□□□□□ -0.99
PKP4-216ENST00000495123 SDE2Q6IQ49 451 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms