RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 DRGXA6NNA5 263 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 PATE3B3GLJ2 98 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 E9PAM4 449 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 SIN3BO75182 1162 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ZNF806P0C7X5 589 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ACADMP11310 421 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ITPKAP23677 461 aa12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 HDAC4P56524 1084 aa12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 SLC36A4Q6YBV0 504 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 CCDC185Q8N715 623 aa12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 FEM1AQ9BSK4 669 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 NUP58Q9BVL2 599 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 VPS45Q9NRW7 570 aa12.36□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 SUN2Q9UH99 717 aa12.36□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 NUMA1Q14980 2115 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 FAM72CH0Y354 149 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 AP5Z1O43299 807 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 CCP110O43303 1012 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 NDUFS2O75306 463 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 FTLP02792 175 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 RHOCP08134 193 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 VAV1P15498 845 aa12.35□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 OXCT1P55809 520 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 RPS14P62263 151 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 OGDHQ02218 1023 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 SLC12A1Q13621 1099 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ARL13BQ3SXY8 428 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 C9orf64Q5T6V5 341 aa12.35□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 RNF214Q8ND24 703 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 GPR174Q9BXC1 333 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 MUC3BQ9H195 1237 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 TMEM74BQ9NUR3 256 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 TMEM51Q9NW97 253 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 OR12D3Q9UGF7 316 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 VPS28Q9UK41 221 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 CEP192Q8TEP8 1941 aa12.35□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 A0A0D9SEW6 157 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PQJ5 194 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD62A6NC57 917 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 SNAP91O60641 907 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 GYPCP04921 128 aa12.34□□□□□ -0.43
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NISCH-214ENST00000490425 ARHGAP8P85298 464 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 SULT2A1Q06520 285 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ZNF33AQ06730 810 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 MAMLD1Q13495 774 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 HGSNATQ68CP4 663 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 SCYL2Q6P3W7 929 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 STK40Q8N2I9 435 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 KDM1BQ8NB78 822 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 VCPIP1Q96JH7 1222 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 HSPA12BQ96MM6 686 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 PSMB7Q99436 277 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ZYG11BQ9C0D3 744 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 ZNF212Q9UDV6 495 aa12.34□□□□□ -0.43
NISCH-214ENST00000490425 PILRBQ9UKJ0 227 aa12.34□□□□□ -0.43
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