RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 B4GALT5O43286 388 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PTPN4P29074 926 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SOX11P35716 441 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MTSS1LQ765P7 747 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 C16orf59Q7L2K0 433 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CYP4Z1Q86W10 505 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 LHX5Q9H2C1 402 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NOD2Q9HC29 1040 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 BMP10O95393 424 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CES1P23141 567 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 RRM2P31350 389 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MATKP42679 507 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DAB2P98082 770 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PGS1Q32NB8 556 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SYTL1Q8IYJ3 562 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TMCC3Q9ULS5 477 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ITGAVP06756 1048 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NEPROQ6NW34 567 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PRMT9Q6P2P2 845 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CYB5D1Q6P9G0 228 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 BBS12Q6ZW61 710 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CCDC3Q9BQI4 270 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CATSPERZQ9NTU4 200 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TMCO1Q9UM00 188 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 LIASO43766 372 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 STAU1O95793 577 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ALADP13716 330 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SCTRP47872 440 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NAA20P61599 178 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 EVX2Q03828 476 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 FBXL19Q6PCT2 694 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 LRRC19Q9H756 370 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MIEF1Q9NQG6 463 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 FCGR1AP12314 374 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NUMBP49757 651 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DRG2P55039 364 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DGKZQ13574 1117 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ITGA7Q13683 1181 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PSMD5Q16401 504 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TJAP1Q5JTD0 557 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 BRMS1LQ5PSV4 323 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 RAP1GAP2Q684P5 730 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NR5A2O00482 541 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB14O43829 449 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 FKBP6O75344 327 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DGKAP23743 735 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CCL23P55773 120 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 VPS33AQ96AX1 596 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DPY30Q9C005 99 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MON2Q7Z3U7 1717 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SHPRHQ149N8 1683 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZNF541Q9H0D2 1346 aa17.35■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 E9PBE3 544 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 KLHL41O60662 606 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 HSDL1Q3SXM5 330 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PHF21BQ96EK2 531 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 HTATIP2Q9BUP3 242 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NLNQ9BYT8 704 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DCLRE1BQ9H816 532 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 IMPAD1Q9NX62 359 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 NUDT5Q9UKK9 219 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CTNNB1P35222 781 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ECM1Q16610 540 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MFSD4BQ5TF39 518 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 C9orf57Q5W0N0 161 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 PLD3Q8IV08 490 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SPPL2BQ8TCT7 592 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 LPPQ93052 612 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZFP42Q96MM3 310 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 H3BQF6 201 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MTA2O94776 668 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 CCNE2O96020 404 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 SLC2A4P14672 509 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 MON1AQ86VX9 555 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ALLCQ8N6M5 410 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 HDAC7Q8WUI4 952 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 STARD8Q92502 1023 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 ZNF510Q9Y2H8 683 aa17.34■□□□□ 0.37
NISCH-213ENST00000489895 KNDC1Q76NI1 1749 aa17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms