RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 ZNF883P0CG24 379 aa22.23■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 SLC8A1P32418 973 aa22.23■■□□□ 1.15
USP40-215ENST00000484528 GRIA4P48058 902 aa22.23■■□□□ 1.15
USP40-215ENST00000484528 GALCP54803 685 aa22.23■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.21■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.21■■□□□ 1.15
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USP40-215ENST00000484528 LRRC72A6NJI9 287 aa22.2■■□□□ 1.14
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USP40-215ENST00000484528 TAF3Q5VWG9 929 aa22.2■■□□□ 1.14
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USP40-215ENST00000484528 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.2■■□□□ 1.14
USP40-215ENST00000484528 EBF2Q9HAK2 575 aa22.2■■□□□ 1.14
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USP40-215ENST00000484528 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
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USP40-215ENST00000484528 CTSKP43235 329 aa22.18■■□□□ 1.14
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USP40-215ENST00000484528 ADPRHP54922 357 aa22.18■■□□□ 1.14
USP40-215ENST00000484528 C21orf59P57076 290 aa22.18■■□□□ 1.14
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