RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474518.1

GCNT2-208, Transcript of glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2 (I blood group), human

TSL 4

Gene GCNT2, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCNT2-208	ENST00000474518	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	MC1R	Q01726	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	EPS8	Q12929	822 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	STK4	Q13043	487 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	FGL2	Q14314	439 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	KYNU	Q16719	465 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	DEFB123	Q8N688	67 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	KRT35	Q92764	455 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	SAMD11	Q96NU1	681 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518		F8W8V4	182 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518		H3BUI4	141 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	SNAP23	O00161	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	STX6	O43752	255 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	RTN2	O75298	545 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	TBX10	O75333	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	KIF20A	O95235	890 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	AMY1A	P04745	511 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	GJB1	P08034	283 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ITGA5	P08648	1049 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CSF1	P09603	554 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	GYPE	P15421	78 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	SYN1	P17600	705 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	DDC	P20711	480 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	IL10	P22301	178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	FGFR4	P22455	802 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CSF2RB	P32927	897 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ADCY7	P51828	1080 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ARFIP1	P53367	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PRMT2	P55345	433 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	RAB1A	P62820	205 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	HTD2	P86397	168 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GCNT2-208	ENST00000474518	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms