RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 ADCY5O95622 1261 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 PDGFRAP16234 1089 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 GOT1P17174 413 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 C5AR1P21730 350 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CD27P26842 260 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 GALCP54803 685 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CDH4P55283 916 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 DEUP1Q05D60 604 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 GRIK2Q13002 908 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 KRT31Q15323 416 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 TEAD4Q15561 434 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CST6Q15828 149 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC31Q6UY01 552 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 GPT2Q8TD30 523 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 IGSF8Q969P0 613 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 BIRC7Q96CA5 298 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ALG14Q96F25 216 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 OMDQ99983 421 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 TKTL2Q9H0I9 626 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 SIK2Q9H0K1 926 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 MTG2Q9H4K7 406 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 PIGVQ9NUD9 493 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 FANCLQ9NW38 375 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 FZD4Q9ULV1 537 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 OR51B4Q9Y5P0 310 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 MID1O15344 667 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ATP9BO43861 1147 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 CER1O95813 267 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ADH1BP00325 375 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 MMEP08473 750 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF18P17022 549 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 SOX5P35711 763 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 STAT1P42224 750 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 SULT1E1P49888 294 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CCR5P51681 352 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 NOMO3P69849 1222 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 CDR2Q01850 454 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 ACCSLQ4AC99 568 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 TAF3Q5VWG9 929 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 TRIM72Q6ZMU5 477 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRF-210ENST00000463041 C14orf80Q86SX3 495 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 CACUL1Q86Y37 369 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 STK40Q8N2I9 435 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 FRS2Q8WU20 508 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 SKA1Q96BD8 255 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRF-210ENST00000463041 SPAG5Q96R06 1193 aa7.49□□□□□ -1.21
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