RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TDGQ13569 410 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC12A1Q13621 1099 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 PDK1Q15118 436 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 PARP15Q460N3 678 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 AFMIDQ63HM1 303 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MNS1Q8NEH6 495 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 RSAD2Q8WXG1 361 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DNASE1L2Q92874 299 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOC4Q96A65 974 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 HAUS1Q96CS2 278 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 HPS4Q9NQG7 708 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 PLK2Q9NYY3 685 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF212Q9UDV6 495 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 HPCAL4Q9UM19 191 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 HEY1Q9Y5J3 304 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 RASA4BC9J798 803 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DFFAO00273 331 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ARNTLO00327 626 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MCF2LO15068 1137 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 RASA4O43374 803 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD11O43934 449 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 GLULP15104 373 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 GNA12Q03113 381 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 GBE1Q04446 702 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ZP2Q05996 745 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF33AQ06730 810 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 GALNT2Q10471 571 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 XRCC4Q13426 336 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DMC1Q14565 340 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 NOMO1Q15155 1222 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 CCNG2Q16589 344 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF354CQ86Y25 554 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 NPWQ8N729 165 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP112Q8N8E3 955 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTL9Q8TC94 416 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MSANTD3Q96H12 275 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ASB2Q96Q27 587 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 AP1M1Q9BXS5 423 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A8Q9C0K1 460 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 KLC2Q9H0B6 622 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MUC3BQ9H195 1237 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC19Q9H756 370 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 GTSE1Q9NYZ3 720 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DTLQ9NZJ0 730 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DEC1Q9P2X7 70 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO10Q9UK96 956 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 H7C0C1 242 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC188H7C350 402 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 MTSS1O43312 755 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 TULP3O75386 442 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ASGR2P07307 311 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 SRFP11831 508 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 GJA4P35212 333 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP5OP48047 213 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DGKGP49619 791 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 PLK1P53350 603 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 LMNB2Q03252 620 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 SULT2A1Q06520 285 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 LMAN2Q12907 356 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 IL31Q6EBC2 164 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 NPNTQ6UXI9 565 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 AHI1Q8N157 1196 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-208ENST00000462602 NAT16Q8N8M0 369 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms