RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 RNF43Q68DV7 783 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 SIX5Q8N196 739 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 FAM3CQ92520 227 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 EXOC4Q96A65 974 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 MSANTD3Q96H12 275 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 RNF14Q9UBS8 474 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 FBXO10Q9UK96 956 aa20.09■□□□□ 0.81
SNHG12-201ENST00000461448 KRBA1A5PL33 1030 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 MAN2B1O00754 1011 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 APOL1O14791 398 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 CEP104O60308 925 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 RHOCP08134 193 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 CISD3P0C7P0 127 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 TUBB2AQ13885 445 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 NLRP14Q86W24 1093 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 EDAQ92838 391 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SHDQ96IW2 340 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.08■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 COL4A2P08572 1712 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 CD70P32970 193 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 MESP2Q0VG99 397 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 LMAN2Q12907 356 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC181Q5TID7 509 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 KAZNQ674X7 775 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.07■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 CST8O60676 142 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 APODP05090 189 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 KRT10P13645 584 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 TGM2P21980 687 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 HLA-FP30511 346 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 LLGL1Q15334 1064 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 GGA2Q9UJY4 613 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 RAD54BQ9Y620 910 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 COL4A3Q01955 1670 aa20.06■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 STK25O00506 426 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 DCLK1O15075 740 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 KAT7O95251 611 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ALADP13716 330 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 CSKP41240 450 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 GRIA2P42262 883 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 PAFAH1B1P43034 410 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 NR2C2P49116 596 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 NUMBP49757 651 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 BBS12Q6ZW61 710 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 TTC13Q8NBP0 860 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 MUC3BQ9H195 1237 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SHISA7A6NL88 538 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 FANCGO15287 622 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SLC34A2O95436 690 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 FGGP02679 453 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 ETFBP38117 255 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 NDST2P52849 883 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 STARD6P59095 220 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SLC12A1Q13621 1099 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 GEN1Q17RS7 908 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SNHG12-201ENST00000461448 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms