RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 RBL1P28749 1068 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 GARSP41250 739 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 LMNB2Q03252 620 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ELF2Q15723 593 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PRUNE1Q86TP1 453 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 GUCD1Q96NT3 240 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TBC1D14Q9P2M4 693 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 CD207Q9UJ71 328 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.88■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 FAM187AA6NFU0 413 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HACD1B0YJ81 288 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 SGK1O00141 431 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 NDST2P52849 883 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 NRLP54845 237 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 GSTA5Q7RTV2 222 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 FAM71DQ8N9W8 422 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 CCNYQ8ND76 341 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 SUSD6Q92537 303 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 BHMTQ93088 406 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HDAC11Q96DB2 347 aa24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 DFFAO00273 331 aa24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 GAS8O95995 478 aa24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ETS1P14921 441 aa24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 VAV1P15498 845 aa24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 MX2P20592 715 aa24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 KCNN4O15554 427 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 AP1B1Q10567 949 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PPP1R7Q15435 360 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 MPPE1Q53F39 396 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TMEM25Q86YD3 366 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 BPIFB1Q8TDL5 484 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 DDI1Q8WTU0 396 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PNKPQ96T60 521 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PLK2Q9NYY3 685 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 UQCRHLA0A096LP55 91 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HEPACAM2A8MVW5 462 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 RASA4BC9J798 803 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 RASA4O43374 803 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 RAMP2O60895 175 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 UQCRHP07919 91 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 LAMP2P13473 410 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 STIP1P31948 543 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 PTK6Q13882 451 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 MPP7Q5T2T1 576 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 FYB2Q5VWT5 728 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 DEFB123Q8N688 67 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 KIAA1958Q8N8K9 716 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 OTUB2Q96DC9 234 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 RTP4Q96DX8 246 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HMCESQ96FZ2 354 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 NECTIN4Q96NY8 510 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 ERP44Q9BS26 406 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 OBP2AQ9NY56 170 aa24.85■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 CFAP69A5D8W1 941 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 IFNB1P01574 187 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 KRT14P02533 472 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TERF1P54274 439 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 GUCY2DQ02846 1103 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 TRADDQ15628 312 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 RNF43Q68DV7 783 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 WFDC5Q8TCV5 224 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 HTR3CQ8WXA8 447 aa24.84■■□□□ 1.57
NME4-209ENST00000460297 BRD8Q9H0E9 1235 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms