RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 KATNAL1Q9BW62 490 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF358Q9NW07 568 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 USP1O94782 785 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 AOC1P19801 751 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 GAD1Q99259 594 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 BRD8Q9H0E9 1235 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 GBA3Q9H227 469 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 BFARQ9NZS9 450 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 Q9Y3F1 56 aa16.38■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 TBX10O75333 385 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 GNAT1P11488 350 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ATP6V1C1P21283 382 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 GRK2P25098 689 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CDC25CP30307 473 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 LIMK2P53671 638 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 GALNT2Q10471 571 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 NRG4Q8WWG1 115 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 AGAP2Q99490 1192 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 AP5M1Q9H0R1 490 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 C1orf21Q9H246 121 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ARL13BQ3SXY8 428 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 FSTL4Q6MZW2 842 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CDH9Q9ULB4 789 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF195O14628 629 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 TM7SF2O76062 418 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 THP07101 528 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 HARS2P49590 506 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CXCR3P49682 368 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 AZIN2Q96A70 460 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 MFSD3Q96ES6 412 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 FAM161BQ96MY7 647 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 PNPOQ9NVS9 261 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 RRN3Q9NYV6 651 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 TRHDEQ9UKU6 1024 aa16.37■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 MTSS1O43312 755 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 F9P00740 461 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 F7P08709 466 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 RALBP11234 206 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 MX2P20592 715 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SLC34A1Q06495 639 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 BLMHQ13867 455 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC153Q494R4 210 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 EDEM1Q92611 657 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF333Q96JL9 665 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 WDCPQ9H6R7 721 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 NMRK1Q9NWW6 199 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 OR12D3Q9UGF7 316 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 E2F8A0AVK6 867 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 F8W8V4 182 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 LRIG2O94898 1065 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ACADSP16219 412 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 NFKB1P19838 968 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CPOXP36551 454 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 VHLP40337 213 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SERPINB8P50452 374 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SESN3P58005 492 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 LPPQ93052 612 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.36■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CPA3P15088 417 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 IDH3AP50213 366 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 ITGA9Q13797 1035 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC6Q16204 474 aa16.35■□□□□ 0.21
SHQ1-202ENST00000444040 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms