RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 GANCQ8TET4 914 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 CLEC4CQ8WTT0 213 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 ZNF606Q8WXB4 792 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 KCTD13Q8WZ19 329 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 SHC3Q92529 594 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 GGA2Q9UJY4 613 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 CNTN6Q9UQ52 1028 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 BTBD3Q9Y2F9 522 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 ASXL3Q9C0F0 2248 aa12.09□□□□□ -0.47
PRAME-210ENST00000442481 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GTQ1 180 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FAM149AA5PLN7 773 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 YJEFN3A6XGL0 299 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 E7ENQ6 273 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 H0Y8X5 98 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 IRAK2O43187 625 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 RFPL3O75679 317 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PRB1P04280 392 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ASLP04424 464 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ITGAVP06756 1048 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 UCHL3P15374 230 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 HLA-FP30511 346 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 KRT9P35527 623 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SLC11A2P49281 568 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 DAOAP59103 153 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 RPS14P62263 151 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 UBXN1Q04323 297 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ILKQ13418 452 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TAF3Q5VWG9 929 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NUGGCQ68CJ6 796 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0895LQ68EN5 471 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 DHRS13Q6UX07 377 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SLC47A2Q86VL8 602 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FMNL3Q8IVF7 1028 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 UNC45BQ8IWX7 931 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SLC35F5Q8WV83 523 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SORCS1Q8WY21 1168 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FAM149B1Q96BN6 582 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PLCB1Q9NQ66 1216 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CNGB3Q9NQW8 809 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 GDF3Q9NR23 364 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ABCC13Q9NSE7 274 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ABCB8Q9NUT2 735 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 STOML2Q9UJZ1 356 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 AK5Q9Y6K8 562 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa12.08□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GTH6 734 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPC4 97 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 LGALS16A8MUM7 142 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ENC1O14682 589 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MAGEC1O60732 1142 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TPM3P06753 285 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 GPD2P43304 727 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ACADSBP45954 432 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SYCP1Q15431 976 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 BSPRYQ5W0U4 402 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TMEM215Q68D42 235 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MBLAC2Q68D91 279 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PM20D1Q6GTS8 502 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 KDM1BQ8NB78 822 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SLC39A7Q92504 469 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 HSFY1Q96LI6 401 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NRSN2Q9GZP1 204 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SYNCQ9H7C4 482 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NLRC4Q9NPP4 1024 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PRSS16Q9NQE7 514 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FBXL12Q9NXK8 326 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FZD4Q9ULV1 537 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CEP83Q9Y592 693 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 KALRNO60229 2985 aa12.07□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TMEM131Q92545 1883 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 E5RJQ4 531 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PLK4O00444 970 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TEX33O43247 280 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MSI1O43347 362 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FBXO21O94952 628 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 MOCS3O95396 460 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 LTFP02788 710 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CD38P28907 300 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 CLCN1P35523 988 aa12.06□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NUDT1P36639 197 aa12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms