RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VCX3AQ9NNX9 186 aa17.67■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SORCS3Q9UPU3 1222 aa17.67■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGEF37A1IGU5 675 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCNFP41002 786 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TEX44Q53QW1 395 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RFX8Q6ZV50 586 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NPAS4Q8IUM7 802 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 E2F7Q96AV8 911 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACBD6Q9BR61 282 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CENPKQ9BS16 269 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 THTPAQ9BU02 230 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDHB8Q9UN66 801 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HOXA2O43364 376 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRAP2O75791 330 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BEST1O76090 585 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZCCHC18P0CG32 403 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LCP1P13796 627 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TYMPP19971 482 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL34P49207 117 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC6A3Q01959 620 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HADHQ16836 314 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RASIP1Q5U651 963 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACAD11Q709F0 780 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM35AQ86V20 835 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PIGZQ86VD9 579 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MTBPQ96DY7 904 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HSFY1Q96LI6 401 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OLFM3Q96PB7 478 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HAPLN3Q96S86 360 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPAS1Q99814 870 aa17.66■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM49D1C9J1S8 452 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRCH4O75427 683 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 APOC2P02655 101 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SERPINA6P08185 405 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM200BP0CF97 657 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IL1R2P27930 398 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BASP1P80723 227 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMPRSS15P98073 1019 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNJ11Q14654 390 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAF5Q15542 800 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM71DQ8N9W8 422 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR10T2Q8NGX3 314 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HCSTQ9UBK5 93 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa17.65■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBKBP1A7MCY6 615 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRT37O76014 449 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACADSBP45954 432 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRNP1Q6NT89 227 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CNKSR3Q6P9H4 555 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 THEM5Q8N1Q8 247 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLEC4CQ8WTT0 213 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VWCEQ96DN2 955 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLPTM1LQ96KA5 538 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZWILCHQ9H900 591 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPM1HQ9ULR3 514 aa17.64■□□□□ 0.42
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VWA8A3KMH1 1905 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C2CD4BA6NLJ0 364 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NRP1O14786 923 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHADO15335 359 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNNO75324 88 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TADA2AO75478 443 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AOC1P19801 751 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPD1P21695 349 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP3K7CLP57077 242 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 XIAPP98170 497 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KDSRQ06136 332 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WASHC5Q12768 1159 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IKBKEQ14164 716 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LGSNQ5TDP6 509 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NECAB2Q7Z6G3 386 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDSS2Q86YH6 399 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CRLF3Q8IUI8 442 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM172AQ8WUF8 416 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RXFP2Q8WXD0 754 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYLPFQ96A32 169 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM209Q96SK2 561 aa17.64■□□□□ 0.41
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TTC1Q99614 292 aa17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms