RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3B-206ENST00000436282 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
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TOP3B-206ENST00000436282 E2F8A0AVK6 867 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 KPNA7A9QM74 516 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 G3V2L1 256 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 H3BSA7 217 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2C8P10632 490 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 CEACAM7Q14002 265 aa15.24■□□□□ 0.03
TOP3B-206ENST00000436282 DPYSL2Q16555 572 aa15.24■□□□□ 0.03
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