RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 TCAF2A6NFQ2 919 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 H0Y8X5 98 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 HSF2BPO75031 334 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PON1P27169 355 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CTSKP43235 329 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 UBE2HP62256 183 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC12A1Q13621 1099 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PTPRN2Q92932 1015 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 LAMA5O15230 3695 aa20.12■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ADH1BP00325 375 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GRK6P43250 576 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PTK2Q05397 1052 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SULT2A1Q06520 285 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SCAPQ12770 1279 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 NME3Q13232 169 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 FBXL22Q6P050 247 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 AADATQ8N5Z0 425 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SYNCQ9H7C4 482 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 VILLO15195 856 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PCDHGA12O60330 932 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 IL1BP01584 269 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 VAV1P15498 845 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GOT1P17174 413 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 C5AR1P21730 350 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 KRT9P35527 623 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 OXCT1P55809 520 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 IL9RQ01113 521 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CENPCQ03188 943 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SKA1Q96BD8 255 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 EBF2Q9HAK2 575 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SIX2Q9NPC8 291 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 DNAJC12Q9UKB3 198 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 APC2O95996 2303 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ACACAQ13085 2346 aa20.1■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 DAB1O75553 588 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ERBB2P04626 1255 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CCR5P51681 352 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PLK1P53350 603 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ADPRHP54922 357 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SNX16P57768 344 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 INAVAQ3KP66 663 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 MLKLQ8NB16 471 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SPAG5Q96R06 1193 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.09■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 TAF4O00268 1085 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 TNFSF14O43557 240 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 DFNA5O60443 496 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 WNT1P04628 370 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 CLCN1P35523 988 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 GGCXP38435 758 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC6A3Q01959 620 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 MTA1Q13330 715 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 KCNJ12Q14500 433 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 MAN2A1Q16706 1144 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ACCSLQ4AC99 568 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PROSER1Q86XN7 944 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 FRS2Q8WU20 508 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 HS3ST4Q9Y661 456 aa20.08■□□□□ 0.81
CCDC189-201ENST00000433909 ATRXP46100 2492 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC189-201ENST00000433909 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC189-201ENST00000433909 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC189-201ENST00000433909 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC189-201ENST00000433909 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.07■□□□□ 0.8
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms