RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 SPATA21Q7Z572 469 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 ITIH5Q86UX2 942 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 RFX6Q8HWS3 928 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 TMC8Q8IU68 726 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 PCDH19Q8TAB3 1148 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 FBF1Q8TES7 1133 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 SLC39A13Q96H72 371 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 ATP6V1C1P21283 382 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 SLC29A2Q14542 456 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 MAP7D3Q8IWC1 876 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 PQLC3Q8N755 202 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 RUNDC3BQ96NL0 473 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 RNF157Q96PX1 679 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 TLR6Q9Y2C9 796 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 COCHO43405 550 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 TJP3O95049 919 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 HMBSP08397 361 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 GAREM2Q75VX8 874 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 GRAMD1AQ96CP6 724 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 ZNF670Q9BS34 389 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 ASB3Q9Y575 518 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 RASGRF2O14827 1237 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 CALB2P22676 271 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 CCR1P32246 355 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 TBX4P57082 545 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 SNX1Q13596 522 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 AUHQ13825 339 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 ARL13BQ3SXY8 428 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 HECTD3Q5T447 861 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 TIFAQ96CG3 184 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 FAF2Q96CS3 445 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 CSPG4P5Q96PW8 444 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 RNF38Q9H0F5 515 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 PRO3102Q9H379 93 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 TXLNGQ9NUQ3 528 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 NOTCH4Q99466 2003 aa25.08■■□□□ 1.61
CTU1-201ENST00000421832 SLC12A8A0AV02 714 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 KCNU1A8MYU2 1149 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 CREB3O43889 395 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 PHF2O75151 1096 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 GABRR2P28476 465 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 ATP5DP30049 168 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 KCNJ1P48048 391 aa25.08■■□□□ 1.6
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CTU1-201ENST00000421832 SEMA3BQ13214 749 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 PPP2R5DQ14738 602 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 CYP1B1Q16678 543 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 ZNF697Q5TEC3 545 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 ANO7Q6IWH7 933 aa25.08■■□□□ 1.6
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CTU1-201ENST00000421832 CORO1BQ9BR76 489 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 EFR3BQ9Y2G0 817 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 STK38LQ9Y2H1 464 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa25.08■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 DPPA5A6NC42 116 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 A8MUI8 341 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 PAGE1O75459 146 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 BRMS1LQ5PSV4 323 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 NPNTQ6UXI9 565 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 JAMLQ86YT9 394 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 ZNF276Q8N554 614 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 SLC22A12Q96S37 553 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 DCLK3Q9C098 648 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 ETNK2Q9NVF9 386 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 SMIM24O75264 130 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 UNC5CO95185 931 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 GJA1P17302 382 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 CDC25CP30307 473 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 CYP4F8P98187 520 aa25.06■■□□□ 1.6
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CTU1-201ENST00000421832 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 DYDC1Q8WWB3 177 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 CKAP2Q8WWK9 683 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 TMEM237Q96Q45 408 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 CYP2S1Q96SQ9 504 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 TRIM31Q9BZY9 425 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 SIK2Q9H0K1 926 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 TCP11X1B4DZS4 312 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 ACADSP16219 412 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 AMPD1P23109 780 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 IFNAR2P48551 515 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 NRIP1P48552 1158 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 KCNQ1P51787 676 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 TXNDC8Q6A555 127 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU1-201ENST00000421832 KIF2BQ8N4N8 673 aa25.06■■□□□ 1.6
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