RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RAD51BO15315 384 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF862O60290 1169 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CXCR5P32302 372 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RCVRNP35243 200 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GMFBP60983 142 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2BQ00403 316 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP1Q07960 439 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C2orf54Q08AI8 447 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 STX5Q13190 355 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KYNUQ16719 465 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 UGCGQ16739 394 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C11orf91Q3C1V1 193 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 C5orf22Q49AR2 442 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EEF1DP3Q658K8 133 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP68Q76N32 757 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX32Q86XE0 403 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC2A14Q8TDB8 520 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RNFT2Q96EX2 444 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NSL1Q96IY1 281 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FOPNLQ96NB1 174 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TCF25Q9BQ70 676 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GORASP1Q9BQQ3 440 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EHD1Q9H4M9 534 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM165Q9HC07 324 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CD248Q9HCU0 757 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NDFIP2Q9NV92 336 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CLDND1Q9NY35 253 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A087WXM4 84 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 B2RBV5 119 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 B4GALT5O43286 388 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CDH16O75309 829 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ACSL3O95573 720 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC166P0CW27 439 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RAD23AP54725 363 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GALCP54803 685 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC18A3Q16572 532 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MEI1Q5TIA1 1274 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CST9Q5W186 159 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR93Q6P2C0 686 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SVOPQ8N4V2 548 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 S100ZQ8WXG8 99 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 THTPAQ9BU02 230 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KIFC1Q9BW19 673 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL33A6NCF5 533 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD63C9JTQ0 380 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SNX2O60749 519 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FSBPO95073 299 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDH8O95206 1070 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM8O95777 96 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 PAEPP09466 180 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM58BPP0C7Q3 252 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ZCCHC18P0CG32 403 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 GABRR2P28476 465 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 BRCC3P46736 316 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 STARP49675 285 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RHOAP61586 193 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 DLG1Q12959 904 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 CBX3Q13185 183 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 MTFR1Q15390 333 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 P3H1Q32P28 736 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 FUT10Q6P4F1 479 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.5□□□□□ -1.69
ANKRD28-202ENST00000412318 SLFN11Q7Z7L1 901 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms