RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC5A9Q2M3M2 681 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 STXBP5Q5T5C0 1151 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 C6orf118Q5T5N4 469 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 PPIL6Q8IXY8 311 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CPXM2Q8N436 756 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 FATE1Q969F0 183 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC39A8Q9C0K1 460 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF576Q9H609 170 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF212Q9UDV6 495 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TRHDEQ9UKU6 1024 aa25.18■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RNF103O00237 685 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 LEFTY2O00292 366 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CNTN5O94779 1100 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TCF3P15923 654 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RFWD3Q6PCD5 774 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 HDXQ7Z353 690 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 PRUNE1Q86TP1 453 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC33Q8N5R6 958 aa25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RFXAPO00287 272 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 WEE1P30291 646 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 SLMAPQ14BN4 828 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ANO4Q32M45 955 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RHBDF2Q6PJF5 856 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 MREGQ8N565 214 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 KIF9Q9HAQ2 790 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TDP1Q9NUW8 608 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa25.16■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CHADO15335 359 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 FDFT1P37268 417 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ETFBP38117 255 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 IRAK1P51617 712 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 NTHL1P78549 312 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 BASP1P80723 227 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ZXDBP98169 803 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TMC5Q6UXY8 1006 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC110Q8TBZ0 833 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 WBP2Q969T9 261 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 IGFLR1Q9H665 355 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 NDFIP2Q9NV92 336 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 SEPT10Q9P0V9 454 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RASA4BC9J798 803 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RASA4O43374 803 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF783Q6ZMS7 281 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 TP53INP2Q8IXH6 220 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 PHACTR1Q9C0D0 580 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 MAGEH1Q9H213 219 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 RAB6BQ9NRW1 208 aa25.15■■□□□ 1.62
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM153BP0C7A2 387 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 WASHC5Q12768 1159 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 HYAL1Q12794 435 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM153CQ494X1 144 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TCEAL5Q5H9L2 206 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 SPDYCQ5MJ68 293 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MPP7Q5T2T1 576 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GPR149Q86SP6 731 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 NETO2Q8NC67 525 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 NSMCE1Q8WV22 266 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM153AQ9UHL3 310 aa25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 GFRA2O00451 464 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MATN3O15232 486 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 TP73O15350 636 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 MAFKO60675 156 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 CEBPBP17676 345 aa25.13■■□□□ 1.61
ECHDC3-201ENST00000379215 PTPN3P26045 913 aa25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms