RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR27A2RRH5 827 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM72CH0Y354 149 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 I6L893 689 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 KLHL2O95198 593 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 AMHP03971 560 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 CLCNKBP51801 687 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 HUNKP57058 714 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 SARNPP82979 210 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 RABGAP1LQ5R372 815 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM72BQ86X60 149 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 MFN1Q8IWA4 741 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 LPPQ93052 612 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNK16Q96T55 309 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 TTC1Q99614 292 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM192AQ9GZU8 254 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 PIDD1Q9HB75 910 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM105AQ9NUU6 356 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 GLRA3O75311 464 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 RGS2P41220 211 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 GLUD2P49448 558 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 ZMIZ2Q8NF64 920 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 ZFAND2BQ8WV99 257 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF778Q96MU6 729 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 EMCNQ9ULC0 261 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa24.46■■□□□ 1.51
AMIGO1-201ENST00000369862 LYNP07948 512 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM163BP0C2L3 166 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 IRX4P78413 519 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXB2Q5VYV0 432 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 C17orf99Q6UX52 265 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 HACE1Q8IYU2 909 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PCED1BQ96HM7 432 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 APBA2Q99767 749 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM96AQ9H5X1 160 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PPM1HQ9ULR3 514 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 DCLK1O15075 740 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 BAG2O95816 211 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC1A6P48664 564 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 DAOAP59103 153 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM35AQ86V20 835 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CCNYQ8ND76 341 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP2A3Q93084 1043 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 RRAGCQ9HB90 399 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC17A6Q9P2U8 582 aa24.45■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ITM2AO43736 263 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 OPHN1O60890 802 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 AP1G2O75843 785 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MLNP12872 115 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PSMB4P28070 264 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 NIPAL4Q0D2K0 466 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC16Q13042 620 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PDK1Q15118 436 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC8BQ6P9F7 803 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF567Q8N184 647 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TRPV1Q8NER1 839 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CDKL2Q92772 493 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC28BQ9BUN5 200 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.44■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MEI4A8MW99 385 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PLIN3O60664 434 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CTSHP09668 335 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ADRA1BP35368 520 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 DCDC2Q9UHG0 476 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 BUD23O43709 281 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 THP07101 528 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf46Q6P387 395 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CASC4Q6P4E1 433 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 PACS1Q6VY07 963 aa24.43■■□□□ 1.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC25A41Q8N5S1 370 aa24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms