RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 BTN3A1O00481 513 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RRAGCQ9HB90 399 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SAR1AQ9NR31 198 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ME2P23368 584 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PAX3P23760 479 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PCID2Q5JVF3 399 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PIGZQ86VD9 579 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DHFR2Q86XF0 187 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 BAP1Q92560 729 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 AMHP03971 560 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SERAC1Q96JX3 654 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ACADMP11310 421 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SGCGQ13326 291 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD52Q8NB46 1076 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CDH9Q9ULB4 789 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 EPHB6O15197 1021 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 KRT20P35900 424 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NCF4Q15080 339 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RNF157Q96PX1 679 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 INPP4BO15327 924 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DCXO43602 365 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SEC22BO75396 215 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-10P10266 1014 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FGFR1P11362 822 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MED8Q96G25 268 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FZD1Q9UP38 647 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINA4P29622 427 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RPS7P62081 194 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC19Q9H756 370 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 NCANO14594 1321 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 LIASO43766 372 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 MSCO60682 206 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PLK1P53350 603 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FMO1Q01740 532 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 BBS12Q6ZW61 710 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SEPHS2Q99611 448 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 STK39Q9UEW8 545 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.62■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087X1B8 175 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 H3BMM5 538 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 IL2P60568 153 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 UROC1Q96N76 676 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SASH3O75995 380 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PIF1Q9H611 641 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PIGNO95427 931 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ATP6V1G2O95670 118 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 LDLRP01130 860 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TSHRP16473 764 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 PSMB4P28070 264 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SLC34A1Q06495 639 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 CRYMQ14894 314 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TERB1Q8NA31 727 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB14O43829 449 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ETS1P14921 441 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF8P28908 595 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 SOX6P35712 828 aa20.61■□□□□ 0.89
CCSAP-203ENST00000366687 ALDH9A1P49189 494 aa20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms