RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 LGMNQ99538 433 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 C10orf88Q9H8K7 445 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 GDF3Q9NR23 364 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM114A2Q9NRY5 505 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 DFFAO00273 331 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 GFRA2O00451 464 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 RAMP2O60895 175 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CYBBP04839 570 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ADCY8P40145 1251 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF77Q15935 545 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PARP15Q460N3 678 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MPP7Q5T2T1 576 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 C4orf22Q6V702 233 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 SEC14L1Q92503 715 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 LRRC45Q96CN5 670 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 OTUB2Q96DC9 234 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TSGA13Q96PP4 275 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PNKPQ96T60 521 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 HINFPQ9BQA5 517 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NDFIP2Q9NV92 336 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 RAB21Q9UL25 225 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CDH7Q9ULB5 785 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NOTCH4Q99466 2003 aa20.05■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 OBSL1O75147 1896 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TBL1XO60907 577 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TBX10O75333 385 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CCNCP24863 283 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 USP4Q13107 963 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CUL1Q13616 776 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NETO2Q8NC67 525 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 BBOF1Q8ND07 529 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 DDI1Q8WTU0 396 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 IFT81Q8WYA0 676 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 RTP4Q96DX8 246 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ASB16Q96NS5 453 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MAGEH1Q9H213 219 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 SNX24Q9Y343 169 aa20.04■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 RASA4BC9J798 803 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NDC80O14777 642 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 RASA4O43374 803 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 P3H1Q32P28 736 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 POTEHQ6S545 545 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 E2F7Q96AV8 911 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 P2RY11Q96G91 374 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 DPH5Q9H2P9 285 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 OBP2AQ9NY56 170 aa20.03■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 EYSQ5T1H1 3165 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ILVBLA1L0T0 632 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 C5orf60A6NFR6 353 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 GCATO75600 419 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ITIH2P19823 946 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TNFRSF8P28908 595 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 LTBRP36941 435 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ETFBP38117 255 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 GDF10P55107 478 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CALCOCO2Q13137 446 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 PAK5Q9P286 719 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.02■□□□□ 0.8
VSTM2B-201ENST00000335523 ESYT3A0FGR9 886 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms